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醫學預科 · 有機化學與生化 · 46 頁->筆記
醫學預科 · 有機化學與生化

有機化學與酶動力學複習資料

有機化學機制講義、生化酶動力學表格和圖像題。

46 頁

醫學預科有機化學與生物化學複習資料。重點包括親核取代反應、立體化學、溶劑效應、酶動力學圖像、抑制類型和胺基酸性質判斷。

複習項目核心內容關鍵條件
SN2一步背面進攻,產物構型反轉甲基或一級底物、強親核試劑、極性非質子溶劑
SN1形成碳正離子中間體,可能外消旋化三級底物、穩定碳正離子、極性質子溶劑
競爭性抑制表觀 Km 增加,Vmax 不變抑制劑與底物競爭活性位點
非競爭性抑制Vmax 降低,簡化模型中 Km 通常不變功能性酶數量下降
有機化學講義 · 生物化學圖表 · 酶動力學表

親核取代反應中,親核試劑取代離去基。反應中心碳、離去基、親核試劑強弱、溶劑類型和產物立體化學共同決定該反應更符合 SN1 還是 SN2。

SN2 是一步協同反應。親核試劑從離去基背面進攻,離去基同時離開。反應速率同時依賴底物濃度和親核試劑濃度,因此速率式中會出現兩個反應物。

SN2 最適合甲基底物和一級底物,因為背面進攻路徑空間阻礙小。二級底物在較強條件下可能發生 SN2。三級底物會明顯阻擋背面進攻,因此通常不利於 SN2。

強親核試劑支持 SN2。極性非質子溶劑不強烈包圍帶負電的親核試劑,因此親核性保持較高。常見例子包括丙酮、二甲基亞碸、二甲基甲醯胺和乙腈。

如果反應中心碳是手性中心,SN2 的背面進攻會導致構型反轉。產物圖中楔形鍵和虛線鍵的變化可以作為判斷 SN2 的證據。

SN1 主要包括兩個階段:離去基先離開,形成碳正離子中間體;隨後親核試劑進攻碳正離子。決速步驟主要依賴底物濃度。

三級底物更有利於 SN1,因為碳正離子中間體可以被烷基取代和超共軛穩定。二級底物在部分條件下可能反應。甲基和一級碳正離子通常不穩定。

極性質子溶劑可以穩定離子,並支持碳正離子形成。弱親核試劑也可以參與 SN1,因為親核試劑並不參與決速步驟。

碳正離子中間體是平面結構。親核試劑可以從任意一面進攻,因此當反應中心為手性中心時,產物可能出現外消旋化或部分外消旋化。

強鹼、加熱和體積較大的鹼會使反應更偏向消除反應。E2 是一步協同反應,並依賴反式共平面構型;E1 和 SN1 都會經過碳正離子特徵。

米氏方程圖描述底物濃度和反應速率之間的關係。Km 是反應速率達到一半 Vmax 時的底物濃度。Vmax 表示酶活性位點飽和時的最大反應速率。

競爭性抑制會使表觀 Km 增加,因為需要更多底物才能達到一半 Vmax。在簡化模型中,Vmax 不變,因為高底物濃度可以競爭掉抑制劑的影響。

非競爭性抑制會降低 Vmax,因為可用的功能性酶數量下降。在簡化模型中,Km 通常不變,因為主要變化不是底物結合親和力。

雙倒數圖中,縱軸截距等於 1/Vmax,橫軸截距等於 -1/Km。縱軸截距改變表示 Vmax 改變;橫軸截距改變表示 Km 改變。

在生理 pH 下,酸性側鏈通常帶負電,鹼性側鏈通常帶正電,疏水性殘基常位於蛋白質非極性內部。判斷胺基酸性質時,需要同時考慮電荷、pKa 和局部環境。

機制練習頁腳:底物、親核試劑、溶劑、離去基、立體化學、Km、Vmax 和圖像截距必須和對應反應或酶系統放在一起解釋。
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醫學預科機制判斷與材料推理筆記

按有機化學機制講義和生化酶動力學資料生成的機制判斷筆記:先讀材料條件,再判斷機制、圖像變化和答案理由。

1. SN1/SN2 先看底物
  • 甲基或一級底物更支持 SN2。
  • 三級底物因為空間阻礙不利於背面進攻,更可能支持 SN1。
  • 強親核試劑是 SN2 支持條件,但不能覆蓋底物條件。
  • 極性非質子溶劑支持 SN2;極性質子溶劑更能穩定 SN1 中間體。
2. 立體化學是機制證據

SN2 透過背面進攻產生構型反轉;SN1 形成平面碳正離子,因此有外消旋化風險。題目如果給出產物構型,要把它當成判斷機制的證據。

3. 酶動力學先看 Km 和 Vmax
  • 競爭性抑制:表觀 Km 增加,Vmax 不變。
  • 非競爭性抑制:Vmax 下降,Km 在簡化模型中通常不變。
  • 雙倒數圖上,縱軸截距對應 1/Vmax。
  • 看到圖像或表格先判斷變數變化方向,再選答案。
4. 先讀材料再調用規則

題目材料裡的底物、溶劑、抑制劑濃度、突變、pH 和圖像座標軸都可能改變判斷。先讀條件,再調用規則,不要先按熟悉選項作答。

5. 機制對照表
因素SN1 傾向SN2 傾向
底物三級更有利甲基或一級更有利
親核試劑可以較弱通常較強
溶劑極性質子溶劑支持極性非質子溶劑支持
立體化學外消旋化風險構型反轉
6. 酶抑制類型對比
抑制類型KmVmax
競爭性抑制表觀 Km 增加Vmax 不變
非競爭性抑制簡化模型中通常不變Vmax 下降
反競爭性抑制Km 下降Vmax 下降
混合型抑制Km 可能上升或下降Vmax 下降
7. 一句話總結

醫學預科題目先看條件,再調用規則;能解釋為什麼某個條件改變答案,才算真正掌握。

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